[+] Реалм Duplodnaviria

Вирусы > реалм Duplodnaviria

Включает все ДНК-вирусы с 2 цепочками, которые кодируют HK97 как основной белок капсида.

Название как раз отсылает к 2 цепочкам ДНК.

[+] Отряд Herpesvirales [+] Отряд Caudovirales

Также имеют ряд других характерных особенностей:

• 20-гранный капсид
• Отверстие в капсиде, называемое порталом. Находится на одной из 12 вершин (у 20-гранника 12 вершин)
• Фермент протеаза, который опорожняет внутреннюю часть капсида (я так понял разрушает белковый скаффолд, то есть каркасный белок, необходимый для сборки капсида) перед упаковкой ДНК
• Фермент терминаза, который упаковывает ДНК вируса в капсид
• Многие представители способны сохраняться в хозяине длительное время без репликации, сохраняя возможность вновь проявиться в будущем.

2 отряда:

• бактериофаги Caudovirales, заражающие прокариот. Имеют «хвост» (и название Caudo с лат. значит «хвост»). Этот хвост собирается отдельно от капсида и присоединяется к нему в районе портальной поры. Вызывают лизис и смерть клетки-хозяина. Распространены повсеместно и являются основной причиной гибели прокариотов. Возможно древнейшие из существующих вирусов.
• вирусы герпеса Herpesvirales, заражающие эукариот. Не вызывают смерть клетки-хозяина, а выходят из клетки при помощи отпочковывания от клеточной мембраны. Поэтому их капсиды сверху покрыты липидным бислоем (суперкапсиды).

Включают единственное царство — Heunggongvirae. Отсылка к Hong-Kong, к бактериофагу Escherichia virus HK97, впервые обнаруженному в Гонконге. Именно в основном белке капсида этого вируса была впервые обнаружена характерная укладка, присутствующая у всех членов царства.

После того, как рибосомы заражённой клетки синтезировали достаточное количество белка HK97, его молекулы начинают собираться в капсид. В сборке капсида участвуют белки скаффолда (каркасные белки), которые направляют сборку и оказываются внутри новообразованного капсида. Перед загрузкой ДНК в капсид белки скаффолда расщепляются специальной протеазой, освобождая пространство внутри капсида. Отверстие в капсиде (портал) необходимо для входа в капсид и выхода из него вирусной ДНК.

Параллельно сборке капсидов, заражённая клетка копирует ДНК вируса. В результате получается длинные молекулы, состоящие из повторяющихся копий ДНК вируса. Вирусный фермент терминаза распознаёт ДНК вируса, связывается с ним, прикрепляется к отверстию в капсиде и начинает упаковывать ДНК в капсид. При этом разрезает на отдельные геномы со свободными концами.

Если вам есть что дополнить в статье — напишите это в комментариях.