Относится к Линейным Соленоидным доменам — доменам, состоящим из тандемных повторов, но эти повторы не замыкаются друг с другом в кольцо.
LRR состоит из 20-30 Аминокислот, многие из которых — гидрофобная Аминокислота Лейцин.
Каждый повтор имеет структуру бета-Нить — Поворот — альфа-Спираль. Собранный домен из множества повторов имеет подковообразную форму с внутренним параллельным бета-Листом и внешним массивом Спиралей. Одна сторона бета-Листа и одна сторона Спиралей подвергается воздействию растворителя, следовательно в них преобладают Гидрофильные Аминокислоты. А область между ними представляет из себя Гидрофобное ядро Белка и плотно упакована Лейцинами.
Есть во многих белках с разными функциями.
Представители:
- Макрофин, aka Фактор сшивания микротрубочек-актина 1, aka Трабекулин α: MACF1
- Гемзависимые пероксидазы животных: PXDN, PXDNL
- Нексин-Динеин регуляторный комплекс (N-DRX): DRC3, TCTE1, FBXL13
- Белки, содержащие F-box и LRR: SKP2, FBXL2, FBXL3, FBXL4, FBXL5, FBXL6, FBXL7, FBXL12, FBXL13, FBXL14, FBXL15, FBXL16, FBXL18, FBXL19, FBXL20, KDM2A, KDM2B
- Белок, содержащий домены LRR и GUK: LRGUK
- NOD-подобные рецепторы (NLR):
- Подсемейство NOD: NOD1, NOD2, NOD3, NOD4, NOD5, CIITA
- Подсемейство NLRP: NLRP1, NLRP2, NLRP3, NLRP4, NLRP5, NLRP6, NLRP7, NLRP8, NLRP9, NLRP11, NLRP12, NLRP13, NLRP14
- Подсемейство IPAF: IPAF, NAIP
- p53-индуцированный белок, содержащий Домен Смерти: PIDD1
- Белки Центросомы: CEP72, CEP97
- Семейство FAM: FAM89B
- Белки, ассоциированные с Ресничками и Жгутиками: CFAP410
- Злокачественная фиброзная гистиоцитома — амплифицированная последовательность 1: MFHAS1
- Семейство TKL Серин/Треониновые протеинкиназы: LRRK1, LRRK2
- Семейство CCR4/Nocturin: CNOT6, CNOT6L
- Семейство NXF: NXF1, NXF2, NXF5
- Факторы сборки Динеина Аксонемы: DNAAF1, DNAAF11
- Супрекомплекс сборки Тубулина: TBCE, TBCEL
- Нисхарин: NISCH
- Адгезионные GPCR: ADGRA2, ADGRA3
- Семейство LGI: LGI1, LGI2, LGI3, LGI4
- Подсемейство Инсулинового рецептора: NTRK1, NTRK2, NTRK3
- Ингибиторы NF-kB: TONSL
- Протеин-фосфатаза, содержащая Домен PH и Повторы LRR: PHLPP
- Протеин-фосфатаза 2, содержащая Домен PH и Повторы LRR: PHLPP2
- Белок 1, содержащий Повторы LRR и Повторы WD40: LRWD1
- Семейство Zyg-11: ZYG11A, ZYG11B, ZER1
- Белки, содержащие Повторы LRR и Домен CH: LRCH1, LRCH2, LRCH4
- Комплекс DISP: LRCH3
- Белки FLRT: FLRT1, FLRT2, FLRT3
- Белок 1, содержащий Повторы LRR, Домен IgC2 и Трасмембранный домен: LRIT1, LRIT2, LRIT3
- Семейство AMIGO: AMIGO1, AMIGO2, AMIGO3
- Семейство LRFN: LRFN1, LRFN2, LRFN3, LRFN4, LRFN5
- Нейрональные белки, содержащие Повторы LRR: LRRN1, LRRN2, LRRN3, LRRN4
- Вазорин: VASN
- Семейство CARMIL: CARMIL1, CARMIL2, CARMIL3
- Белок, содержащий Повторы LRR и Домен Спиральная спираль: LRRCC1
- Трофобластный гликопротеин, и подобный белок: TPBG, TPBGL
- Ингибитор Рибонуклеазы: RNH1
- Семейство малых протеогликанов, богатых лейцином (SLRP): ASPN, BGN, DCN, ECM2, FMOD, KERA, LUM, OMD, PRELP, EPYC, OGN, OPTC, CHAD, CHADL, NYX, PODN, PODNL1
- Белки, содержащие Повторы LRR и Домен IgC2: LRIG1, LRIG2, LRIG3
- Толл-подобные рецепторы (TLR): TLR1, TLR2, TLR3, TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10, CD180
- Семейство белков Slit: SLIT1, SLIT2, SLIT3
- Семейство SLITRK: SLITRK1, SLITRK2, SLITRK3, SLITRK4, SLITRK5, SLITRK6
- E3 убиквитин-протеиновая лигаза LRSAM1: LRSAM1
- Рецептор Гликопротеин Ib Тромбоцитов: GP1BA, GP1BB
- Гликопротеин V Тромбоцитов: GP5
- Гликопротеин IX Тромбоцитов: GP9
- Белок, содержащий Ig-подобный домен и Повторы LRR: ISLR
- Белок 2, содержащий Ig-подобный домен и Повторы LRR: ISLR2
- Белки, содержащий Домен IgC2 и Повторы LRR, взаимодействующие с Рецептором Nogo: LINGO1, LINGO2, LINGO3, LINGO4
- Семейство LAP (LRR и PDZ): ERBIN, LRRC7, SCRIB
- Антиген CD14 Дифференцировки Моноцитов: CD14
- Трансмембранный белок CCDC168, содержащий Повторы LRR: CCDC168
- Кисло-лабильная субъединица Комплекса белка, связывающего Инсулино-подобный Фактор роста: IGFALS
- Семейство LRRC32/LRRC33: LRRC32, NRROS
- Карбоксипептидаза N: CPN2
- Гликопротеин Олигодендроцитов-Миелина: OMG
- Интерактор TLR4, содержащий Повторы LRR: TRIL
- Гомолог Белка Flightless-1: FLII
- Белок SHOC-2, содержащий Повторы LRR: SHOC2
- Протеинфосфатазы 1 (PPP1): PPP1R7, PPP1R37, PPP1R42, ELFN2
- Семейство LRRTM: LRRTM1, LRRTM2, LRRTM3, LRRTM4
- Альфа-2-гликопротеин, содержащий Повторы LRR: LRG1
- Родопсиновые GPCR-рецепторы: FSHR, TSHR, LHCGR, LGR4, LGR5, LGR6, RXFP1, RXFP2
- Белок, взаимодействующий с Серин/Треонин-протеинкиназой 11: STK11IP
- Тсукуши: TSKU
- Семейство Nogo рецепторов: RTN4R, RTN4RL1, RTN4RL2
- Белок 1, ассоциированный с устойчивостью к рентгеновскому излучению: XRRA1
- Семейство альфа-субъединицы протеина пренилтрансферазы: RABGGTA
- Член 10 Суперсемейства Иммуноглобулинов: IGSF10
- Центриолин: CNTRL
- Белок 5, связанный с ремоделированием матрикса: MXRA5
- Семейство Субъединицы s АТФ-синтазы: DMAC2L
- Динеины: DNAL1
- Рибонуклеопротеин A’ U2 мяРНК: SNRPA1
- C-Maf-индуцирующий белок: CMIP
- Ran ГТФаза-активирующий белок 1: RANGAP1
- Семейство ANP32: ANP32A, ANP32B, ANP32D, ANP32E
- Адаптерный белок 1, содержащий Повторы LRR: LURAP1
- Семейство Полицистины: PKD1
- Белки, содержащие Повторы LRR и Трансмембранный домен: LRTM1, LRTM2
- Белок ELFN1: ELFN1
- Белок-супрессор Ras 1: RSU1
- Белки, содержащие Повторы LRR и Домен IQ: LRRIQ1, LRRIQ3, LRRIQ4
- Белок, связанный с дифференцировкой Меланоцитов, содержащий Повторы LRR: LRMDA
- Белок 1, содержащий Повторы LRR и Домен Смерти: LRRD1
- Белок 2, содержащий Домен NACHT и Повторы WD40: NWD2
- Семейство PRAME: LRRC14, LRRC14B, PRAME, PRAMEF1, PRAMEF2, PRAMEF4, PRAMEF5, PRAMEF6, PRAMEF7, PRAMEF8, PRAMEF9, PRAMEF10, PRAMEF11, PRAMEF12, PRAMEF14, PRAMEF15, PRAMEF17, PRAMEF18, PRAMEF19, PRAMEF20, PRAMEF22, PRAMEF25, PRAMEF26, PRAMEF27, PRAMEF33
- Комплекс Тубулин полиглутамилазы: LRRC49
- Белки, содержащие домен LRR:
- Белок 1, содержащий Повторы LRR. Ген LRR1
- Белок 1, содержащий Повторы LRR. Ген LRRC1. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC2
- LRRC3
- LRRC3B
- LRRC3C
- LRRC4. Содержит Домен IgC2
- LRRC4B. Содержит Домен IgC2
- LRRC4C. Содержит Домен IgC2
- LRRC8A. Содержит Мотив Di-leucine
- LRRC8B
- LRRC8C
- LRRC8D
- LRRC8E
- LRRC9
- LRRC10
- LRRC10B
- LRRC15
- LRRC17
- LRRC18
- LRRC19
- LRRC20
- LRRC23. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC24. Содержит Домен IgC2
- LRRC25
- LRRC26
- LRRC27. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC28
- LRRC30
- LRRC31
- LRRC34
- LRRC36. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC37A
- LRRC37A2
- LRRC37A3
- LRRC37B. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC38
- LRRC39. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC40
- LRRC41
- LRRC42
- LRRC43
- LRRC45. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC46. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC47. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC51
- LRRC52
- LRRC53
- LRRC55
- LRRC56
- LRRC57
- LRRC58
- LRRC59. Содержит Домен Спиральная спираль
- LRRC61
- LRRC63
- LRRC66
- LRRC69
- LRRC70
- LRRC71
- LRRC72
- LRRC73
- LRRC74A
- LRRC74B
- LRRC75A
- LRRC75B
Дополнение
Как я понял, есть ещё LRRCT и LRRNT — LRR на C- и N-конце. Их отдельно пишут, видимо чем-то отличаются. Точнее даже вроде не на C- и N-конце белка, а непосредственно череды доменов LRR.
Если вам есть что дополнить в статье — напишите это в комментариях.
